موتورهای کاوش در اینترنت به 2 نوع عمده موتورهای کاوش راهنما و نمایه ای تقسیم می شوند:

1-    موتورهای کاوش راهنما : این دسته از موتورهای کاوش با استفاده از رده های موضوعی که توسط اشخاص نمایه ساز تهیه شده است ، کار می کنند . این راهنماها سبب می شوند تا استفاده کننده بتواند صفخات وب ، و رده های موضوعی از پیش تعیین و تعریف شده را مرور کند . شناخته شده ترین این راهنماها Yahoo است .

2-    موتورهای کاوش نمایه ای : این دسته از موتورهای کاوش در زمره شناخته شده ترین و کارآمد ترین موتور های کاوش در اینترنت هستند و از نوعی نظام نمایه سازی ماشینی یا خودکار برای منابع اینترنت استفاده می کنند. معمول ترین کاربرد این دسته از ابزارهای کاوش ، جستجوی سایت ها و صفحات وب در اینترنت است.